Manusia Petugas CIA Moira MacTaggert secara tidak sengaja mengungkap keberadaan Hellfire Club, sebuah organisasi misterius yang dipimpin oleh Schmidt, sekarang beroperasi dengan identitas Sebastian Shaw, dan beberapa mutan lainnya. Moria meminta nasihat Charles tentang mutasi, yang menyebabkan dia bekerja dengan CIA untuk membentuk gugus tugas untuk menghentikan Shaw, termasuk Raven, Erik, Dr. Hank McCoy, Angel Salvadore, Armando Muñoz, Alex Summers, dan Sean Cassidy.
Armando tewas dalam serangan terhadap mutan oleh Hellfire Club, dan pertempuran tersebut menjadi sarang Krisis Rudal Kuba saat Shaw memanipulasi pasukan di Moskow untuk memasang ICBM di Kuba. Dalam pertempuran berikutnya, Shaw dibunuh oleh Erik, dan Charles lumpuh dari pinggang ke bawah karena peluru yang dibelokkan oleh kekuatan magnet Erik. Perpecahan ideologis antara keduanya membuat Erik, yang sekarang bernama Magneto, mengajak Raven, anggota Klub Api Neraka yang masih hidup, dan Angel untuk membentuk Persaudaraan Mutan, sementara Charles memutuskan untuk kembali ke tanah miliknya di Westchester untuk membuka sekolah bagi Siswa yang “berbakat”. (X-Men: Kelas Satu)
